Cette école thématique propose une introduction aux simulations de dynamique moléculaire avec une forte composante pratique. Après une brève introduction à la théorie liée aux simlation de dynamique moléculaire, les participants suivront de nombreux travaux pratiques sur ordinateur. Ils apprendront à construire et simuler les systèmes biomoléculaires les plus importants : protéines globulaires, complexes protéine-acide nucléique et protéine-ligand, protéines membranaires. Les systèmes seront simulés en tout-atome mais une introduction au gros-grain sera également abordée. Une partie importante comprendra l'analyse des simulations (analyses classiques, clustering, analyse en composante principale, machine learning). Une introduction à l'échantillonnage augmenté sera également abordée (umbrella sampling) avec une application pratique sur un système protéine-ligand.

L'école s'adresse aux personnes débutantes et intermédiaires cherchant à acquérir des bases théoriques et pratiques solides en simulation de dynamique moléculaire. Elle est ouverte aux doctorants, post-doctorants ou chercheurs/enseignants-chercheurs. Le public visé inclus aussi bien des chercheurs en bioinfomatique structurale qui débutent que des chercheurs expérimentateurs (biophysiciens, biochimistes, chimistes, etc.) souhaitant se former à la dynamique moléculaire. 

A l'issue de la semaine, le vendredi 22 mai, l'Atelier de Modélisation des Molécules d'Intérêt Biologique (AMMIB 2026) sera organisé sur le même campus. Nous encourageons les participants de l'école thématique à y assister (https://ammib2026.sciencesconf.org) afin d'assister à des présentations qui porteront sur l'étude de systèmes biomoléculaires par des approches de simulation de dynamique moléculaire.